Panamá estará representado en 16 deportes, 17 modalidades deportivas, y participarán en 68 pruebas.
La nadadora Olímpica Emily Santos, y el atleta Ronnier Martínez del Levantamiento de Pesas, fueron escogidos de manera unánime como los abanderados de Panamá para los I Juegos Panamericanos Junior Cali 2021. Santos es la segunda atleta más joven de Panamá en competir en unos Juegos Olímpicos, con su participación en la pasada edición Tokyo 2020 y Ronnier Martínez fue finalista de la final de los -62kg de los pasados Juegos Olímpicos de la Juventud Buenos Aires 2018 y más recientemente fue medallista de bronce en el Campeonato Panamericano Sub 20.